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NMR solution structure of the De novo designed small beta-barrel protein 33_bp_sh3
Authors
Peterson, F.C., Kim, D.E., Jensen, D.R., Saleem, A., Chow, C.M., Volkman, B.F., Baker, D.
Assembly
De novo designed small beta-barrel protein 33 bp sh3
Entity
1. De novo designed small beta-barrel protein 33 bp sh3 (polymer, Thiol state: not present), 62 monomers, 7159.795 Da Detail

MDGFDRGADV TYTDSDGSKK TYKVLSYSGD KVTVQDSDGR TLTFDARLLR VKKWLEHHHH HH


Formula weight
7159.795 Da
Source organism
synthetic construct
Exptl. method
solution NMR
Data set
assigned_chemical_shifts, spectral_peak_list
Chemcal Shifts
1H: 389, 13C: 245, 15N: 60 assignments Detail
IDEntity IDSeq IDComp IDAtom IDAtom typeValVal errAmbig. code
111METHAH3.9800.000
211METHB2H2.0560.000
311METHB3H2.0560.000
411METHG2H2.5580.000
511METHG3H2.5580.000
611METHE1H2.0420.000
711METHE2H2.0420.000
811METHE3H2.0420.000
911METCAC55.7860.000
1011METCBC34.0980.000
1111METCGC31.5090.000
1211METCEC17.2900.000
1312ASPHAH4.6140.000
1412ASPHB2H2.6860.000
1512ASPHB3H2.6130.000
1612ASPCC175.8510.000
1712ASPCAC55.1520.000
1812ASPCBC41.9900.000
1913GLYHH8.2430.000
2013GLYHA2H3.7890.000
2113GLYHA3H3.6390.000
2213GLYCC173.8090.000
2313GLYCAC45.4980.000
2413GLYNN108.1120.000
2514PHEHH7.5920.000
2614PHEHAH4.5010.000
2714PHEHB2H2.8970.000
2814PHEHB3H2.5860.000
2914PHEHD1H6.8420.000
3014PHEHD2H6.8420.000
3114PHEHE1H7.1290.000
3214PHEHE2H7.1290.000
3314PHEHZH7.2350.000
3414PHECC174.5950.000
3514PHECAC57.1830.000
3614PHECBC39.5460.000
3714PHECD1C131.5320.000
3814PHECE1C131.5320.000
3914PHECZC129.9780.000
4014PHENN119.5030.000
4115ASPHH7.8280.001
4215ASPHAH4.6730.000
4315ASPHB2H2.6960.000
4415ASPHB3H2.5030.000
4515ASPCC175.9040.000
4615ASPCAC53.9510.000
4715ASPCBC42.6110.000
4815ASPNN120.8500.000
4916ARGHH8.4470.001
5016ARGHAH3.8800.000
5116ARGHB2H1.8480.000
5216ARGHB3H1.8480.000
5316ARGHG2H1.8310.000
5416ARGHG3H1.6340.000
5516ARGHD2H3.2970.000
5616ARGHD3H3.2970.000
5716ARGCC177.6180.000
5816ARGCAC58.3430.000
5916ARGCBC30.2640.000
6016ARGCGC27.7370.000
6116ARGCDC44.0620.000
6216ARGNN121.3020.000
6317GLYHH9.0320.001
6417GLYHA2H4.3250.000
6517GLYHA3H3.7430.000
6617GLYCC173.9290.000
6717GLYCAC45.5110.000
6817GLYNN113.5480.000
6918ALAHH8.0670.000
7018ALAHAH4.3860.000
7118ALAHB1H1.4990.000
7218ALAHB2H1.4990.000
7318ALAHB3H1.4990.000
7418ALACC176.8780.000
7518ALACAC52.8320.000
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7718ALANN123.3670.000
7819ASPHH8.2470.000
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8019ASPHB2H2.6320.000
8119ASPHB3H2.4930.000
8219ASPCC176.7680.000
8319ASPCAC54.4890.000
8419ASPCBC42.6940.000
8519ASPNN119.7510.000
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97110VALCBC35.6090.000
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101111THRHH8.8390.001
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107111THRCC173.6380.000
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109111THRCBC71.6980.000
110111THRCG2C22.0190.000
111111THRNN116.1520.000
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113112TYRHAH4.8680.000
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115112TYRHB3H2.6420.000
116112TYRHD1H6.8290.000
117112TYRHD2H6.8290.000
118112TYRHE1H6.6700.000
119112TYRHE2H6.6700.000
120112TYRCC174.2730.000
121112TYRCAC56.7680.000
122112TYRCBC42.9000.000
123112TYRCD1C133.3440.000
124112TYRCE1C118.5840.000
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127113THRHAH4.6990.000
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129113THRHG21H1.1180.000
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131113THRHG23H1.1180.000
132113THRCC173.3590.000
133113THRCAC61.9330.000
134113THRCBC69.8330.000
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137114ASPHH8.5600.000
138114ASPHAH4.6510.000
139114ASPHB2H3.0320.000
140114ASPHB3H2.7790.000
141114ASPCC178.4950.000
142114ASPCAC53.0810.000
143114ASPCBC42.8190.000
144114ASPNN126.2660.000
145115SERHH9.1200.006
146115SERHAH4.2070.000
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149115SERCC175.0180.000
150115SERCAC61.2840.000
151115SERCBC63.5760.000
152115SERNN116.7850.000
153116ASPHH8.1210.000
154116ASPHAH4.6630.000
155116ASPHB2H2.9780.000
156116ASPHB3H2.7330.000
157116ASPCC177.2330.000
158116ASPCAC54.0340.000
159116ASPCBC40.8710.000
160116ASPNN119.5540.000
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163117GLYHA3H3.5600.000
164117GLYCC174.6630.000
165117GLYCAC45.5400.000
166117GLYNN108.8270.000
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169118SERHB2H3.9700.000
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171118SERCC173.3990.000
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182119LYSHD3H1.6020.000
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184119LYSHE3H2.9430.000
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217121THRCBC70.8700.000
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227122TYRHE2H6.6240.000
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232122TYRCE1C118.3250.000
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259124VALHG23H0.9610.000
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261124VALCAC65.5020.000
262124VALCBC32.6680.000
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265124VALNN124.1640.000
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Release date
2022-05-30
Citation
De novo design of small beta barrel proteins
Kim, D.E., Jensen, D.R., Feldman, D., Tischer, D., Saleem, A., Chow, C.M., Li, X., Carter, L., Milles, L., Nguyen, H., Kang, A., Bera, A.K., Peterson, F.C., Volkman, B.F., Ovchinnikov, S., Baker, D.
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. (2023), 120, e2207974120-e2207974120, PubMed 36897987 , DOI 10.1073/pnas.2207974120 ,
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  BMRB: 31017 released on 2022-05-30
    Title NMR solution structure of the De novo designed small beta-barrel protein 29_bp_sh3
Related entities 1. De novo designed small beta-barrel protein 33 bp sh3, : 1 : 12 entities Detail
Experiments performed 3 experiments Detail
Chemical shift validation 3 contents Detail
Keywords DE NOVO PROTEIN, high-throughput screening, machine learning, protein design, small beta barrels