BMRB: 34489

Designing a Granulopoietic Protein by Topological Rescaffolding 1: Sohair

Authors

ElGamacy, M., Coles, M.

Assembly

sohair

Entity

1. sohair (polymer, Thiol state: not present), 175 monomers, 20261.79 Da Detail

MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MMTSDYIIEQ IQRKQEEARL KVEEMERKLE AVKEASKRGV SSDQLLNLIL DLADIITTLI QIIEESNEAI KELIKNQKGP TSDYIIEQIQ RDQEEARKKV EEAEERLERV KEASKRGVSS DQLLDLIREL AEIIEELIRI IRRSNEAIKE LIKNQ

Formula weight

20261.79 Da

Source organism

synthetic construct

Exptl. method

solution NMR

Refine. method

NOESY back-calculation

Data set

assigned_chemical_shifts

Chemcal Shifts

¹H: 531, ¹³C: 644, ¹⁵N: 159 assignments Detail

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ID	Entity ID	Seq ID	Comp ID	Atom ID	Atom type	Val	Val err	Ambig. code
1	1	22	MET	H	H	8.45	0.02	1
2	1	22	MET	HA	H	4.64	0.02	1
3	1	22	MET	HB2	H	2.21	0.02	1
4	1	22	MET	HB3	H	2.02	0.02	1
5	1	22	MET	HG2	H	2.64	0.02	1
6	1	22	MET	HG3	H	2.57	0.02	1
7	1	22	MET	HE1	H	2.15	0.02	1
8	1	22	MET	HE2	H	2.15	0.02	1
9	1	22	MET	HE3	H	2.15	0.02	1
10	1	22	MET	C	C	176.25	0.05	1
11	1	22	MET	CA	C	55.7	0.05	1
12	1	22	MET	CB	C	33.35	0.05	1
13	1	22	MET	CG	C	32.16	0.05	1
14	1	22	MET	CE	C	17.2	0.05	1
15	1	22	MET	N	N	121.54	0.05	1
16	1	23	THR	H	H	8.15	0.02	1
17	1	23	THR	HA	H	4.53	0.02	1
18	1	23	THR	HB	H	4.49	0.02	1
19	1	23	THR	HG21	H	1.39	0.02	1
20	1	23	THR	HG22	H	1.39	0.02	1
21	1	23	THR	HG23	H	1.39	0.02	1
22	1	23	THR	C	C	175.11	0.05	1
23	1	23	THR	CA	C	61.93	0.05	1
24	1	23	THR	CB	C	70.13	0.05	1
25	1	23	THR	CG2	C	22.09	0.05	1
26	1	23	THR	N	N	114.53	0.05	1
27	1	24	SER	H	H	8.6	0.02	1
28	1	24	SER	HA	H	4.44	0.02	1
29	1	24	SER	HB2	H	4.05	0.02	1
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31	1	24	SER	C	C	175.04	0.05	1
32	1	24	SER	CA	C	59.99	0.05	1
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34	1	24	SER	N	N	117.36	0.05	1
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37	1	25	ASP	HB2	H	2.75	0.02	1
38	1	25	ASP	HB3	H	2.75	0.02	1
39	1	25	ASP	C	C	177.41	0.05	1
40	1	25	ASP	CA	C	56.24	0.05	1
41	1	25	ASP	CB	C	40.61	0.05	1
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1292	1	171	LEU	CD2	C	24.17	0.05	1
1293	1	171	LEU	N	N	119.71	0.05	1
1294	1	172	ILE	H	H	8.15	0.02	1
1295	1	172	ILE	HA	H	3.93	0.02	1
1296	1	172	ILE	HB	H	2.11	0.02	1
1297	1	172	ILE	C	C	176.64	0.05	1
1298	1	172	ILE	CA	C	64.3	0.05	1
1299	1	172	ILE	CB	C	38.21	0.05	1
1300	1	172	ILE	CG1	C	29.13	0.05	1
1301	1	172	ILE	N	N	117.26	0.05	1
1302	1	173	LYS	H	H	7.61	0.02	1
1303	1	173	LYS	HA	H	4.28	0.02	1
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1311	1	173	LYS	CG	C	24.83	0.05	1
1312	1	173	LYS	CD	C	29.39	0.05	1
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1334	1	175	GLN	NE2	N	111.72	0.05	1

Protein Blocks Logo

Calculated from 19 models in PDB: 6Y07, Strand ID: A Detail

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Release date

2020-03-10

Citation 1

Mapping Local Conformational Landscapes of Proteins in Solution
ElGamacy, M., Riss, M., Zhu, H., Truffault, V., Coles, M.
Structure (2019), 27, 853-865, PubMed 30930065 , DOI 10.1016/j.str.2019.03.005 , Abstract

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Citation 2

Design of novel granulopoietic proteins by topological rescaffolding
Alvarez, B.H., Skokowa, J., Coles, M., Mir, P., Nasri, M., Maksymenko, K., Weidmann, L., Rogers, K.W., Welte, K., Lupas, A.N., Muller, P., ElGamacy, M.
PLoS Biol. (2020), 18, e3000919-e3000919, PubMed 33351791 , DOI 10.1371/journal.pbio.3000919 , Abstract

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