BMRB: 34613

Solution structure of Boskar4; a de novo designed G-CSF agonist

Authors

ElGamacy, M., Coles, M.

Assembly

Boskar4

Entity

1. Boskar4 (polymer, Thiol state: not present), 121 monomers, 13000.84 Da Detail

LAAALAEIYK GLAEYQARLK SLEGISPELG PALDALRLDM ADFATTMAQA MEEGLDSLPQ SFLLKALEQI RKIQADAAAL REKLAATYKG NDRAAAAVEI AAQLEAFLEK AYQILRHLAA A

Formula weight

13000.84 Da

Source organism

synthetic construct

Exptl. method

solution NMR

Data set

assigned_chemical_shifts

Chemcal Shifts

¹H: 791, ¹³C: 495, ¹⁵N: 115 assignments Detail

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ID	Entity ID	Seq ID	Comp ID	Atom ID	Atom type	Val	Val err	Ambig. code
1	1	1	LEU	HA	H	4.20	0.02	1
2	1	1	LEU	HB2	H	1.93	0.02	1
3	1	1	LEU	HB3	H	1.80	0.02	1
4	1	1	LEU	HG	H	1.82	0.02	1
5	1	1	LEU	HD11	H	1.03	0.02	1
6	1	1	LEU	HD12	H	1.03	0.02	1
7	1	1	LEU	HD13	H	1.03	0.02	1
8	1	1	LEU	HD21	H	1.02	0.02	1
9	1	1	LEU	HD22	H	1.02	0.02	1
10	1	1	LEU	HD23	H	1.02	0.02	1
11	1	1	LEU	C	C	177.94	0.05	1
12	1	1	LEU	CA	C	58.03	0.05	1
13	1	1	LEU	CB	C	41.83	0.05	1
14	1	1	LEU	CG	C	27.29	0.05	1
15	1	1	LEU	CD1	C	25.99	0.05	1
16	1	1	LEU	CD2	C	25.13	0.05	1
17	1	2	ALA	H	H	8.37	0.02	1
18	1	2	ALA	HA	H	4.23	0.02	1
19	1	2	ALA	HB1	H	1.62	0.02	1
20	1	2	ALA	HB2	H	1.62	0.02	1
21	1	2	ALA	HB3	H	1.62	0.02	1
22	1	2	ALA	C	C	180.36	0.05	1
23	1	2	ALA	CA	C	55.68	0.05	1
24	1	2	ALA	CB	C	18.26	0.05	1
25	1	2	ALA	N	N	120.72	0.05	1
26	1	3	ALA	H	H	7.92	0.02	1
27	1	3	ALA	HA	H	4.37	0.02	1
28	1	3	ALA	HB1	H	1.62	0.02	1
29	1	3	ALA	HB2	H	1.62	0.02	1
30	1	3	ALA	HB3	H	1.62	0.02	1
31	1	3	ALA	C	C	180.34	0.05	1
32	1	3	ALA	CA	C	54.82	0.05	1
33	1	3	ALA	CB	C	18.21	0.05	1
34	1	3	ALA	N	N	119.47	0.05	1
35	1	4	ALA	H	H	8.06	0.02	1
36	1	4	ALA	HA	H	4.24	0.02	1
37	1	4	ALA	HB1	H	1.61	0.02	1
38	1	4	ALA	HB2	H	1.61	0.02	1
39	1	4	ALA	HB3	H	1.61	0.02	1
40	1	4	ALA	C	C	180.39	0.05	1
41	1	4	ALA	CA	C	55.10	0.05	1
42	1	4	ALA	CB	C	18.64	0.05	1
43	1	4	ALA	N	N	121.54	0.05	1
44	1	5	LEU	H	H	8.60	0.02	1
45	1	5	LEU	HA	H	4.17	0.02	1
46	1	5	LEU	HB2	H	2.06	0.02	1
47	1	5	LEU	HB3	H	1.64	0.02	1
48	1	5	LEU	HG	H	2.11	0.02	1
49	1	5	LEU	HD11	H	0.96	0.02	1
50	1	5	LEU	HD12	H	0.96	0.02	1
51	1	5	LEU	HD13	H	0.96	0.02	1
52	1	5	LEU	HD21	H	0.98	0.02	1
53	1	5	LEU	HD22	H	0.98	0.02	1
54	1	5	LEU	HD23	H	0.98	0.02	1
55	1	5	LEU	C	C	181.68	0.05	1
56	1	5	LEU	CA	C	58.24	0.05	1
57	1	5	LEU	CB	C	41.12	0.05	1
58	1	5	LEU	CG	C	27.00	0.05	1
59	1	5	LEU	CD1	C	25.91	0.05	1
60	1	5	LEU	CD2	C	22.98	0.05	1
61	1	5	LEU	N	N	116.84	0.05	1
62	1	6	ALA	H	H	8.04	0.02	1
63	1	6	ALA	HA	H	4.04	0.02	1
64	1	6	ALA	HB1	H	1.71	0.02	1
65	1	6	ALA	HB2	H	1.71	0.02	1
66	1	6	ALA	HB3	H	1.71	0.02	1
67	1	6	ALA	C	C	180.58	0.05	1
68	1	6	ALA	CA	C	55.65	0.05	1
69	1	6	ALA	CB	C	18.15	0.05	1
70	1	6	ALA	N	N	120.31	0.05	1
71	1	7	GLU	H	H	7.94	0.02	1
72	1	7	GLU	HA	H	4.16	0.02	1
73	1	7	GLU	HB2	H	2.25	0.02	1
74	1	7	GLU	HB3	H	1.86	0.02	1
75	1	7	GLU	HG2	H	2.56	0.02	1
76	1	7	GLU	HG3	H	2.36	0.02	1
77	1	7	GLU	C	C	180.26	0.05	1
78	1	7	GLU	CA	C	59.51	0.05	1
79	1	7	GLU	CB	C	29.75	0.05	1
80	1	7	GLU	CG	C	36.25	0.05	1
81	1	7	GLU	N	N	118.57	0.05	1
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83	1	8	ILE	HA	H	4.16	0.02	1
84	1	8	ILE	HB	H	2.05	0.02	1
85	1	8	ILE	C	C	177.55	0.05	1
86	1	8	ILE	CA	C	65.58	0.05	1
87	1	8	ILE	CB	C	38.14	0.05	1
88	1	8	ILE	N	N	121.43	0.05	1
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90	1	9	TYR	HA	H	4.13	0.02	1
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101	1	9	TYR	CD2	C	133.06	0.05	1
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103	1	9	TYR	CE2	C	117.36	0.05	1
104	1	9	TYR	N	N	120.94	0.05	1
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112	1	10	LYS	HD3	H	1.83	0.02	1
113	1	10	LYS	HE2	H	3.14	0.02	1
114	1	10	LYS	HE3	H	3.14	0.02	1
115	1	10	LYS	C	C	179.63	0.05	1
116	1	10	LYS	CA	C	59.63	0.05	1
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118	1	10	LYS	CG	C	25.07	0.05	1
119	1	10	LYS	CD	C	29.58	0.05	1
120	1	10	LYS	CE	C	42.19	0.05	1
121	1	10	LYS	N	N	118.53	0.05	1
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126	1	11	GLY	CA	C	47.17	0.05	1
127	1	11	GLY	N	N	107.00	0.05	1
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129	1	12	LEU	HA	H	4.15	0.02	1
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131	1	12	LEU	HB3	H	1.80	0.02	1
132	1	12	LEU	HG	H	2.10	0.02	1
133	1	12	LEU	HD11	H	1.13	0.02	1
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142	1	12	LEU	CG	C	26.91	0.05	1
143	1	12	LEU	CD1	C	26.12	0.05	1
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146	1	13	ALA	H	H	7.94	0.02	1
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148	1	13	ALA	HB1	H	1.46	0.02	1
149	1	13	ALA	HB2	H	1.46	0.02	1
150	1	13	ALA	HB3	H	1.46	0.02	1
151	1	13	ALA	C	C	181.12	0.05	1
152	1	13	ALA	CA	C	55.28	0.05	1
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154	1	13	ALA	N	N	121.35	0.05	1
155	1	14	GLU	H	H	7.79	0.02	1
156	1	14	GLU	HA	H	4.15	0.02	1
157	1	14	GLU	HB2	H	2.25	0.02	1
158	1	14	GLU	HB3	H	1.86	0.02	1
159	1	14	GLU	HG2	H	2.27	0.02	1
160	1	14	GLU	HG3	H	2.02	0.02	1
161	1	14	GLU	C	C	179.69	0.05	1
162	1	14	GLU	CA	C	59.23	0.05	1
163	1	14	GLU	CB	C	29.12	0.05	1
164	1	14	GLU	CG	C	35.94	0.05	1
165	1	14	GLU	N	N	119.70	0.05	1
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167	1	15	TYR	HA	H	4.08	0.02	1
168	1	15	TYR	HB2	H	2.92	0.02	1
169	1	15	TYR	HB3	H	2.92	0.02	1
170	1	15	TYR	HD1	H	6.88	0.02	1
171	1	15	TYR	HD2	H	6.88	0.02	1
172	1	15	TYR	HE1	H	6.54	0.02	1
173	1	15	TYR	HE2	H	6.54	0.02	1
174	1	15	TYR	C	C	178.39	0.05	1
175	1	15	TYR	CA	C	64.28	0.05	1
176	1	15	TYR	CB	C	38.79	0.05	1
177	1	15	TYR	CD1	C	132.61	0.05	1
178	1	15	TYR	CD2	C	132.61	0.05	1
179	1	15	TYR	CE1	C	118.67	0.05	1
180	1	15	TYR	CE2	C	118.67	0.05	1
181	1	15	TYR	N	N	117.13	0.05	1
182	1	16	GLN	H	H	8.65	0.02	1
183	1	16	GLN	HA	H	4.09	0.02	1
184	1	16	GLN	HB2	H	2.40	0.02	1
185	1	16	GLN	HB3	H	2.29	0.02	1
186	1	16	GLN	HG2	H	2.67	0.02	1
187	1	16	GLN	HG3	H	2.46	0.02	1
188	1	16	GLN	HE21	H	7.23	0.02	1
189	1	16	GLN	HE22	H	6.88	0.02	1
190	1	16	GLN	C	C	178.43	0.05	1
191	1	16	GLN	CA	C	60.46	0.05	1
192	1	16	GLN	CB	C	29.49	0.05	1
193	1	16	GLN	CG	C	34.97	0.05	1
194	1	16	GLN	N	N	119.61	0.05	1
195	1	16	GLN	NE2	N	108.50	0.05	1
196	1	17	ALA	H	H	7.53	0.02	1
197	1	17	ALA	HA	H	4.33	0.02	1
198	1	17	ALA	HB1	H	1.59	0.02	1
199	1	17	ALA	HB2	H	1.59	0.02	1
200	1	17	ALA	HB3	H	1.59	0.02	1
201	1	17	ALA	C	C	180.94	0.05	1
202	1	17	ALA	CA	C	55.13	0.05	1
203	1	17	ALA	CB	C	17.99	0.05	1
204	1	17	ALA	N	N	120.60	0.05	1
205	1	18	ARG	H	H	8.11	0.02	1
206	1	18	ARG	HA	H	4.25	0.02	1
207	1	18	ARG	HB2	H	2.01	0.02	1
208	1	18	ARG	HB3	H	1.93	0.02	1
209	1	18	ARG	HG2	H	1.98	0.02	1
210	1	18	ARG	HG3	H	1.80	0.02	1
211	1	18	ARG	HD2	H	3.03	0.02	1
212	1	18	ARG	HD3	H	3.03	0.02	1
213	1	18	ARG	C	C	179.44	0.05	1
214	1	18	ARG	CA	C	59.08	0.05	1
215	1	18	ARG	CB	C	30.82	0.05	1
216	1	18	ARG	CG	C	27.28	0.05	1
217	1	18	ARG	CD	C	43.75	0.05	1
218	1	18	ARG	N	N	118.25	0.05	1
219	1	19	LEU	H	H	8.39	0.02	1
220	1	19	LEU	HA	H	4.19	0.02	1
221	1	19	LEU	HB2	H	1.93	0.02	1
222	1	19	LEU	HB3	H	1.61	0.02	1
223	1	19	LEU	HG	H	2.12	0.02	1
224	1	19	LEU	HD11	H	0.98	0.02	1
225	1	19	LEU	HD12	H	0.98	0.02	1
226	1	19	LEU	HD13	H	0.98	0.02	1
227	1	19	LEU	HD21	H	0.93	0.02	1
228	1	19	LEU	HD22	H	0.93	0.02	1
229	1	19	LEU	HD23	H	0.93	0.02	1
230	1	19	LEU	C	C	178.97	0.05	1
231	1	19	LEU	CA	C	57.64	0.05	1
232	1	19	LEU	CB	C	41.93	0.05	1
233	1	19	LEU	CG	C	27.39	0.05	1
234	1	19	LEU	CD1	C	26.35	0.05	1
235	1	19	LEU	CD2	C	22.83	0.05	1
236	1	19	LEU	N	N	118.50	0.05	1
237	1	20	LYS	H	H	7.78	0.02	1
238	1	20	LYS	HA	H	4.18	0.02	1
239	1	20	LYS	HB2	H	2.07	0.02	1
240	1	20	LYS	HB3	H	2.07	0.02	1
241	1	20	LYS	HG2	H	1.62	0.02	1
242	1	20	LYS	HG3	H	1.62	0.02	1
243	1	20	LYS	HD2	H	1.84	0.02	1
244	1	20	LYS	HD3	H	1.84	0.02	1
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247	1	20	LYS	C	C	178.64	0.05	1
248	1	20	LYS	CA	C	59.10	0.05	1
249	1	20	LYS	CB	C	32.17	0.05	1
250	1	20	LYS	CG	C	25.02	0.05	1
251	1	20	LYS	CD	C	29.07	0.05	1
252	1	20	LYS	CE	C	42.18	0.05	1
253	1	20	LYS	N	N	119.35	0.05	1
254	1	21	SER	H	H	7.74	0.02	1
255	1	21	SER	HA	H	4.49	0.02	1
256	1	21	SER	HB2	H	4.13	0.02	1
257	1	21	SER	HB3	H	4.13	0.02	1
258	1	21	SER	C	C	174.76	0.05	1
259	1	21	SER	CA	C	60.39	0.05	1
260	1	21	SER	CB	C	63.56	0.05	1
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262	1	22	LEU	H	H	7.61	0.02	1
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1306	1	113	GLN	N	N	115.94	0.05	1
1307	1	113	GLN	NE2	N	112.43	0.05	1
1308	1	114	ILE	H	H	8.26	0.02	1
1309	1	114	ILE	HA	H	3.94	0.02	1
1310	1	114	ILE	HB	H	2.24	0.02	1
1311	1	114	ILE	C	C	178.39	0.05	1
1312	1	114	ILE	CA	C	64.90	0.05	1
1313	1	114	ILE	CB	C	38.29	0.05	1
1314	1	114	ILE	N	N	120.03	0.05	1
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1316	1	115	LEU	HA	H	4.15	0.02	1
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1373	1	118	LEU	CD1	C	26.79	0.05	1
1374	1	118	LEU	CD2	C	23.08	0.05	1
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1399	1	121	ALA	CA	C	53.87	0.05	1
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1401	1	121	ALA	N	N	128.14	0.05	1

Release date

2021-04-13

Citation 1

Mapping Local Conformational Landscapes of Proteins in Solution
ElGamacy, M., Riss, M., Zhu, H., Truffaut, V., Coles, M.
Structure (2019), 27, 853-865, PubMed 30930065 , DOI 10.1016/j.str.2019.03.005 , Abstract

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Citation 2

A topological refactoring design strategy yields highly stable granulopoietic proteins
Skokowa, J., Alvarez, B.H., Coles, M., Ritter, M., Nasri, M., Haaf, J., Aghaallaei, N., Xu, Y., Mir, P., Krahl, A., Rogers, K.W., Maksymenko, K., Bajoghli, B., Welte, K., Lupas, A.N., Muller, P., ElGamacy, M.
Nat. Commun. (2022), 13, 2948-2948, PubMed 35618709 , DOI 10.1038/s41467-022-30157-2 , Abstract

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