- 1-1 初めて登録をするのですが、どうしたらいいですか。
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データ登録に関する流れをまとめたデータ登録の手引きを御覧ください。
「提出するファイル」や「ADIT-NMR 入力項目についての解説」など登録を行うに必要な情報の解説をしています。
- 1-2 ADIT-NMRの操作方法を知りたい。
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データ登録の手引きに載せている以下の資料を参照して頂けます。
* ADIT-NMRの使い方 1 -データの登録や更新-
* ADIT-NMRの使い方 2 -入力画面やボタンの説明-
- 1-3 NMR-STARフォーマットについて詳しく知りたい。
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NMR-STARフォーマットは、下記のような構成になっています。
ADIT-NMRの登録サイトでは、Tag categories＝入力項目（赤字は必須項目）について記述していただきます。
#############################################
# Molecular system (assembly) description # -->Supergroups
#############################################
save_assembly -->Saveframe categories
_Assembly.Sf_category assembly -->Tag categories
_Assembly.Sf_framecode assembly
NMR-STAR Dictionaryに、各カテゴリの説明があります。ご参照ください。
- 1-4 NMR構造データは既にPDB登録済みで、その構造を得るために行ったNMR実験データをBMRBに登録したい。
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A1.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判る場合:
1. ADIT-NMRの「Continue Previous Session」にRestart IDを指定して「CONTINUE SESSION」ボタンを押してください。
当時の続きから入力作業を続けられます。
2.「View Mode」をBMRBに切り替えて、NMR実験データファイルと補足項目を入力してください。
3.「Deposit To BMRB」ボタンを押して登録してください。
A2.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判らない場合:
1. ADIT-NMRの「New ADIT-NMR Session」の「BEGIN」ボタンを押して新Sessionを開始してください。
2.「Data File Upload Form」に既存PDB登録のmmCIFファイルをアップロードしてください。
アップロードファイルの内容が入力項目に反映されます。
3. NMR実験データファイルと補足項目を入力してください。
4.「Deposit To BMRB」ボタンを押して登録してください。新しいIDが発行されます。
- 1-5 NMR実験データは既にBMRB登録済みで、その実験から得たNMR構造データをPDBに登録したい。
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A1.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判る場合:
1. ADIT-NMRの「Continue Previous Session」にRestart IDを指定して「CONTINUE SESSION」ボタンを押してください。
当時の続きから入力作業を続けられます。
2.「View Mode」をPDBに切り替えて、NMR実験データファイルと補足項目を入力してください。
3.「Deposit To PDB」ボタンを押して登録してください。
A2.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判らない場合:
1. ADIT-NMRの「New ADIT-NMR Session」の「BEGIN」ボタンを押して新Sessionを開始してください。
2.「Data File Upload Form」に既存BMRB登録のNMR-STAR(Ver.3)ファイルをアップロードしてください。
アップロードファイルの内容が入力項目に反映されます。
3. NMR実験データファイルと補足項目を入力してください。
4.「Deposit To PDB」ボタンを押して登録してください。新しいIDが発行されます。
- 1-6 既存BMRB・PDB登録を利用して、新しいNMRデータを登録したい。
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A1.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判る場合:
1. ADIT-NMRの「New Session Copied From Previous Deposition」にRestart IDを指定して「NEW SESSION」ボタンを押してください。
当時の続きから入力作業を続けられます。
2. 新しいNMRデータファイルをアップロードし、入力内容を確認して修正したい項目を再入力してください。
3.「Deposit To BMRB/PDB」ボタンを押して登録してください。
A2.登録時のADIT-NMR Session Restart IDが判らない場合:
1. ADIT-NMRの「New ADIT-NMR Session」の「BEGIN」ボタンを押して新Sessionを開始してください。
2.「Data File Upload Form」に既存BMRB/PDB登録のNMR-STAR(Ver.3)/mmCIFファイルをアップロードしてください。
アップロードファイルの内容が入力項目に反映されます。
3. 新しいNMRデータファイルをアップロードし、入力内容を確認して修正したい項目を再入力してください。
4.「Deposit To BMRB/PDB」ボタンを押して登録してください。新しいIDが発行されます。
- 1-7 既存BMRB登録の内容を修正したい。
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ADIT-NMR上では、既存登録の内容の修正は出来ません。
本サイト左端に表示されている緑のFeedbackタブより、登録番号・修正点を明記の上ご連絡ください。
- 1-8 既存PDB登録の内容を修正したい。
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PDBの問い合わせ画面で、メールの件名に「RCSB/PDB ID」を明記の上、修正点をご連絡ください。
