01. Deposit data files

ADIT-NMRで登録作業を行なう前に、以下の項目について入力します。

Entry interview

E-mail:

電子メールアドレスを入力して、「Save Changes」ボタンを押します。 このセッションに再度アクセスするための「Session Restart ID」の記された電子メールが送信されます。

Start a PDB/BMRB deposition or a BMRB only deposition

"PDB/BMRB"と"BMRB Only"のどちらの画面モードで登録作業を行なうか、チェック印を入力して選択します。 これらの画面モードは"PDB/BMRB"あるいは"BMRB Only"登録セッションを画面上で区別するものです。 それぞれの入力が完了すると、PDBあるいはBMRBにデータ登録が可能となります。

参照: 3.「Session Restart ID」の割り当て

作成したNMRデータのファイル、およびPDB登録で必要な原子座標ファイルと制限情報ファイルを、
登録サーバに送信します。

Multiple files may be uploaded by repeated use of this form.

このフォームを使うことで、複数のファイルを、繰り返しアップロードできます。

Step 1: Select a file to upload:

「Browser」もしくは「ファイルを選択」ボタンを押して、アップロードするファイルを指定します。

Step 2: Select the type of data in this file:

ファイルの種類を選択します。

Step 3: Choose file operation:

「Upload」ボタンを押します

Step 4: Repeat steps 1-3 for each file you upload into the deposition.

登録したいファイルをアップロードするごとに、１－３の手順を繰り返して下さい。

参照: 5. BMRB登録の場合　データファイルの送信
参照: 6. PDB/BMRB登録の場合 データファイルの送信

ファイルの種類

NMR data file	NMR dataファイルのアップロードは必須です。
	NMRデータのファイル
	下記どちらかのサイトでNMR-STAR形式へ変換して下さい * STARch file converter * NMR-STAR template Generator（参照：化学シフトファイルの作成方法）
	残基コードは３文字で表記すること。（Alanine → ALA）
	（方法） 1，NMR data fileのチェックボックを選択。 2，下記のNMR Data included in this upload fileの表から、 登録したいファイルの種類を選択して、CLOSEで閉じます。 3，(Containing: ｛ファイルの種類｝)と表示される 4，アップロードする 以上の１－４の手順を、アップロードしたいファイルごとに繰り返す。
Coordinate file (PDB登録のみ)	Coordinateファイルのアップロードは必須です。
	原子座標データのファイル
	PDB フォーマットもしくはmmCIFフォーマットのどちらかの形式であること
	残基コードは３文字で表記すること。（Alanine->ALA）
Constraints (PDB登録のみ)	Constraintsのアップロードは必須です。
	構造計算で使用した制限情報のファイル

NMR Data included in this upload file

Assigned NMR chemical shifts	帰属された化学シフト値のデータを登録する場合
Scalar coupling constants	J結合定数のデータを登録する場合
Heteronuclear NOEs	異種核NOEデータを登録する場合
T1 (R1) NMR relaxation data	T1緩和データを登録する場合
T2 (R2) NMR relaxation data	T2緩和データを登録する場合
T1rho (R1rho) NMR relaxation data	回転座標系におけるスピン－格子緩和データを登録する場合
Order parameters	オーダーパラメータを登録する場合
Residual dipolar couplings	残余双極子結合データを登録する場合
Hydrogen exchange rates	プロトン交換速度のデータを登録する場合
Hydrogen exchange protection data	プロテクションファクタのデータを登録する場合
Spectral peak lists	スペクトルピークのファイルを登録する場合
Homonuclear NOEs (not for NOE restraints)	同種核NOEデータを登録する場合
Dipole-dipole relaxation data	双極子-双極子緩和データを登録する場合
Dipole-dipole cross correlation data	双極子-双極子交差相関データを登録する場合
Dipole-CSA cross correlation data	双極子-CSA交差相関データを登録する場合
NMR-derived pH transitions (pKa's; pHmid's)	NMR解析によるpHタイトレーションのデータを登録する場合
NMR-derived D/H fractionation factors	NMR解析による水素結合に関わるデータを登録する場合
Theoretical (calculated) chemical shift values	計算科学的手法によって得られた化学シフトデータを登録する場合
Spectral density factors	スペクトル密度因子のデータを登録する場合
Other kinds of data	上記以外の新しいタイプのデータを登録する場合
Image file describing the structure of a non-standard residue or ligand.	非標準的な残基やリガンドの、構造がわかる画像ファイル

（注意）最低1つはチェック印を入力して下さい。

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