1. 登録についての一般的情報

必須項目 記入例
登録のタイトル NMR Chemical Shift Assignments for Oxide-stats Cytchrome c
登録データの種類 chemical shift
登録データの公開時期 On publication
登録者、
BMRBとの連絡担当者
氏名 Taro Yamada
所属 Institute for protein reserch, Osaka University
住所 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan
電話番号 +81-6-879-4311
電子メールアドレス -
引用 発表論文の題目 Structure Solution of Oxide-states Cytchrome c
発表論文の出版物種類 journal
名称(発表論文がジャーナルの場合) J. Biomol. NMR
発表論文の出版状況 in preparation
発表論文の著者氏名 Taro Yamada

2. 研究分子についての生化学的情報

必須項目 記入例
研究対象の生体巨大分子(集合体)の構成について
(単量体、複合体あるいは金属結合タンパク質など)
Single polypeptide
構成要素の数
(生体高分子数+有機リガンド数+金属イオン数)
2
集合体について 名称 Cytochrome c
常磁性体かどうか yes
不安定な配座状態の有無 no
構成要素間 化学交換の有無 no
チオール基の状態 all other bound
集合体中の有機リガンド
(構成要素として存在する場合)
その有無
1
名称 Protoporphyrin IX containing Fe
(heme c)
種類 non-polymer
電荷 2+
常磁性体かどうか yes
芳香性をもつかどうか yes
集合体中の金属イオン
(構成要素として存在する場合)
その有無
 
名称  
種類  
電荷  
常磁性体かどうか  
芳香性をもつかどうか  
集合体中の生体高分子 名称 Cytochrome c polypeptide
NMRデータの登録を行うか否か yes
種類 polypeptide(L)
非標準な残基、光学異性体、結合の有無 no
FASTA形式残基配列(残基数) GDVEKGKKIFIMKCSQCHTV
EKGGKHKTGPNLHGLFGRKT
GQAPGYSYTAANKNKGIIWG
EDTLMEYLENPKKYIPGTKM
IFVGIKKKEERADLIAYLKK
ATNE
(104)
物理的状態 native
互いの要素が構造異性体の関係として存在するかどうか no
不安定な配座状態や複数形態の有無 no
常磁性体かどうか yes
チオール基の状態 all other bound
天然的な出所について human
実験的な出所について recombinant technology

3. NMR実験についての情報

必須項目 記入例
化学シフト値の基準 基準物質 DSS
原子名 13C
基準共鳴線に由来する原子基 methyl protons
基準物質と照合原子との関係 .
照合方法 indirect
その基準共鳴線の値 0.0ppm
(基準値を化学シフト比から算出した場合)その定数値 0.251449530
測定試料 物理状態 A solution
測定試料に含まれる物質の名称 Cytchorome c Na Phosphate
濃度 2.0mM 20mM
(同位体標識を施している場合)同位体表記 [U-13C; U-15N] ?
測定条件の変数と誤差 B pH7.0±0.1、298K±0.1
研究で使用したNMR分光器 製造業者 C Burker
モデル DRX
磁場強度(プロトン共鳴周波数 [MHz]) 800

NMR測定 測定名 2D 1H-15N HSQC 3D CBCA(CO)NH
使用した測定試料

(注意)
pHタイトレーション実験など複数調製した場合は
上記(A)に複数記述してNMR測定名との関連付けを行う

試料 A
使用した測定条件 条件 B
使用したNMR分光器 分光器 C
測定で得たデータの登録ファイル名 cs-data.txt