| 必須項目 | 記入例 | |
| 登録のタイトル | NMR Chemical Shift Assignments for Oxide-stats Cytchrome c | |
| 登録データの種類 | chemical shift | |
| 登録データの公開時期 | On publication | |
| 登録者、 BMRBとの連絡担当者 |
氏名 | Taro Yamada |
| 所属 | Institute for protein reserch, Osaka University | |
| 住所 | 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan | |
| 電話番号 | +81-6-879-4311 | |
| 電子メールアドレス | - | |
| 引用 | 発表論文の題目 | Structure Solution of Oxide-states Cytchrome c |
| 発表論文の出版物種類 | journal | |
| 名称(発表論文がジャーナルの場合) | J. Biomol. NMR | |
| 発表論文の出版状況 | in preparation | |
| 発表論文の著者氏名 | Taro Yamada | |
| 必須項目 | 記入例 | |
| 研究対象の生体巨大分子(集合体)の構成について (単量体、複合体あるいは金属結合タンパク質など) |
Single polypeptide | |
| 構成要素の数 (生体高分子数+有機リガンド数+金属イオン数) |
2 | |
| 集合体について | 名称 | Cytochrome c |
| 常磁性体かどうか | yes | |
| 不安定な配座状態の有無 | no | |
| 構成要素間 | 化学交換の有無 | no |
| チオール基の状態 | all other bound | |
| 集合体中の有機リガンド (構成要素として存在する場合) |
その有無 | 有 |
| 数 | 1 | |
| 名称 | Protoporphyrin IX containing Fe (heme c) |
|
| 種類 | non-polymer | |
| 電荷 | 2+ | |
| 常磁性体かどうか | yes | |
| 芳香性をもつかどうか | yes | |
| 集合体中の金属イオン (構成要素として存在する場合) |
その有無 | 無 |
| 数 | ||
| 名称 | ||
| 種類 | ||
| 電荷 | ||
| 常磁性体かどうか | ||
| 芳香性をもつかどうか | ||
| 集合体中の生体高分子 | 名称 | Cytochrome c polypeptide |
| NMRデータの登録を行うか否か | yes | |
| 種類 | polypeptide(L) | |
| 非標準な残基、光学異性体、結合の有無 | no | |
| FASTA形式残基配列(残基数) | GDVEKGKKIFIMKCSQCHTV EKGGKHKTGPNLHGLFGRKT GQAPGYSYTAANKNKGIIWG EDTLMEYLENPKKYIPGTKM IFVGIKKKEERADLIAYLKK ATNE (104) |
|
| 物理的状態 | native | |
| 互いの要素が構造異性体の関係として存在するかどうか | no | |
| 不安定な配座状態や複数形態の有無 | no | |
| 常磁性体かどうか | yes | |
| チオール基の状態 | all other bound | |
| 天然的な出所について | human | |
| 実験的な出所について | recombinant technology | |
| 必須項目 | 記入例 | |||
| 化学シフト値の基準 | 基準物質 | DSS | ||
| 原子名 | 13C | |||
| 基準共鳴線に由来する原子基 | methyl protons | |||
| 基準物質と照合原子との関係 | . | |||
| 照合方法 | indirect | |||
| その基準共鳴線の値 | 0.0ppm | |||
| (基準値を化学シフト比から算出した場合)その定数値 | 0.251449530 | |||
| 測定試料 | 物理状態 | A | solution | |
| 測定試料に含まれる物質の名称 | Cytchorome c | Na Phosphate | ||
| 濃度 | 2.0mM | 20mM | ||
| (同位体標識を施している場合)同位体表記 | [U-13C; U-15N] | ? | ||
| 測定条件の変数と誤差 | B | pH7.0±0.1、298K±0.1 | ||
| 研究で使用したNMR分光器 | 製造業者 | C | Burker | |
| モデル | DRX | |||
| 磁場強度(プロトン共鳴周波数 [MHz]) | 800 | |||
| NMR測定 | 測定名 | 2D 1H-15N HSQC | 3D CBCA(CO)NH |
|
使用した測定試料 (注意) |
試料 A | ||
| 使用した測定条件 | 条件 B | ||
| 使用したNMR分光器 | 分光器 C | ||
| 測定で得たデータの登録ファイル名 | cs-data.txt | ||