必須項目 | 記入例 | |
登録のタイトル | NMR Chemical Shift Assignments for Oxide-stats Cytchrome c | |
登録データの種類 | chemical shift | |
登録データの公開時期 | On publication | |
登録者、 BMRBとの連絡担当者 |
氏名 | Taro Yamada |
所属 | Institute for protein reserch, Osaka University | |
住所 | 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan | |
電話番号 | +81-6-879-4311 | |
電子メールアドレス | - | |
引用 | 発表論文の題目 | Structure Solution of Oxide-states Cytchrome c |
発表論文の出版物種類 | journal | |
名称(発表論文がジャーナルの場合) | J. Biomol. NMR | |
発表論文の出版状況 | in preparation | |
発表論文の著者氏名 | Taro Yamada |
必須項目 | 記入例 | |
研究対象の生体巨大分子(集合体)の構成について (単量体、複合体あるいは金属結合タンパク質など) |
Single polypeptide | |
構成要素の数 (生体高分子数+有機リガンド数+金属イオン数) |
2 | |
集合体について | 名称 | Cytochrome c |
常磁性体かどうか | yes | |
不安定な配座状態の有無 | no | |
構成要素間 | 化学交換の有無 | no |
チオール基の状態 | all other bound | |
集合体中の有機リガンド (構成要素として存在する場合) |
その有無 | 有 |
数 | 1 | |
名称 | Protoporphyrin IX containing Fe (heme c) |
|
種類 | non-polymer | |
電荷 | 2+ | |
常磁性体かどうか | yes | |
芳香性をもつかどうか | yes | |
集合体中の金属イオン (構成要素として存在する場合) |
その有無 | 無 |
数 | ||
名称 | ||
種類 | ||
電荷 | ||
常磁性体かどうか | ||
芳香性をもつかどうか | ||
集合体中の生体高分子 | 名称 | Cytochrome c polypeptide |
NMRデータの登録を行うか否か | yes | |
種類 | polypeptide(L) | |
非標準な残基、光学異性体、結合の有無 | no | |
FASTA形式残基配列(残基数) | GDVEKGKKIFIMKCSQCHTV EKGGKHKTGPNLHGLFGRKT GQAPGYSYTAANKNKGIIWG EDTLMEYLENPKKYIPGTKM IFVGIKKKEERADLIAYLKK ATNE (104) |
|
物理的状態 | native | |
互いの要素が構造異性体の関係として存在するかどうか | no | |
不安定な配座状態や複数形態の有無 | no | |
常磁性体かどうか | yes | |
チオール基の状態 | all other bound | |
天然的な出所について | human | |
実験的な出所について | recombinant technology |
必須項目 | 記入例 | |||
化学シフト値の基準 | 基準物質 | DSS | ||
原子名 | 13C | |||
基準共鳴線に由来する原子基 | methyl protons | |||
基準物質と照合原子との関係 | . | |||
照合方法 | indirect | |||
その基準共鳴線の値 | 0.0ppm | |||
(基準値を化学シフト比から算出した場合)その定数値 | 0.251449530 | |||
測定試料 | 物理状態 | A | solution | |
測定試料に含まれる物質の名称 | Cytchorome c | Na Phosphate | ||
濃度 | 2.0mM | 20mM | ||
(同位体標識を施している場合)同位体表記 | [U-13C; U-15N] | ? | ||
測定条件の変数と誤差 | B | pH7.0±0.1、298K±0.1 | ||
研究で使用したNMR分光器 | 製造業者 | C | Burker | |
モデル | DRX | |||
磁場強度(プロトン共鳴周波数 [MHz]) | 800 |
NMR測定 | 測定名 | 2D 1H-15N HSQC | 3D CBCA(CO)NH |
使用した測定試料 (注意) |
試料 A | ||
使用した測定条件 | 条件 B | ||
使用したNMR分光器 | 分光器 C | ||
測定で得たデータの登録ファイル名 | cs-data.txt |