Jun 25 - Jul 1, 2023

BioHackathon 2023に出席して、この時の成果のプレプリントがBioHackrXiveに掲載されました。

Sep 6, 2023

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v4.4.29をリリースしました。

Jul 7, 2023

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v4.4.7/5.3.7をリリースしました。

Jan 6, 2023

BMRB/BMRBjの活動に関する論文がNucleic Acid Res.に掲載されました。

Dec 19, 2022

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v4.4.3/5.3.3をリリースしました。

Dec 20, 2022

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v4.4.14をリリースしました。

Jan 11, 2022

構造が収束している領域を示すプロットがNMR制限情報を可視化したコンテンツに追加されました。

Jan 8, 2022

BMRBjの活動に関する論文がProtein Scienceに掲載されました。

Oct 5, 2021

AlphaFold Protein Structure Databaseの配列情報を各BMRBエントリーのBLAST検索結果として加えました。

Sep 24, 2021

BMRB/XMLとBMRB/RDFを更新しました。BMRB/XML及びBMRB/RDFの名前空間がそれぞれ変更されます。

Sep 21, 2021

BMRBメタボロミクスエントリーのためのnmrML変換ツールBMSxNmrML v1.3.0をリリースしました。

Aug 18, 2021

データ登録者は、専用のオーサービューページ上で主要引用文献のPubMed IDを指定するすることで、自身のOn-Holdエントリーの公開を要請することができるようになりました。

Jul 30, 2021

化学シフト検証レポートを可視化したコンテンツを追加しました。

Jul 29, 2021

全てのBMRBエントリーの化学シフト検証レポートをJSONフォーマットで公開しました。スキーマは、NMR統合データアーカイブのレポートファイルのスキーマと同じものです。

Jul 26, 2021

データ登録者は、アップロードまたは処理したデータファイルについて、専用のオーサービューページにアクセスできるようになりました。このページは詳細な検証情報、可視化された要約コンテンツを含みます。

Jul 13, 2021

RCIと派生パラメータ(S², NMR RMSD)のプロットがNMR制限情報を可視化したコンテンツに加わりました。

Apr 21, 2021

新しい４文字のCCD IDを含むエントリーや８文字のPDB IDのエントリーは、PDB形式では提供できなくなります。wwPDB NEWS

Dec 28, 2021

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v4.2.3/5.1.3をリリースしました。

Jan 28, 2021

BMRBエントリーに関する統計情報ページを更新しました。

Jan 21, 2021

PDBと同時登録したBMRBエントリーのNMR制限情報を可視化したコンテンツを追加しました。

Dec 17, 2021

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v4.4.4をリリースしました。

Dec 24, 2020

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v5.0.0をリリースしました。動作環境は、JDK14以上になります。

Dec 16, 2020

NMR制限情報の検証レポートに対応した代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v3.0.0をリリースしました。

Nov 17, 2020

NMR統合データアーカイブのレポートファイルに対応するJSONスキーマを公開しました。このレポートファイルは、制限情報の統計及び診断情報を含みます。

Oct 23, 2020

PDBエントリーに結び付けられたNMR統合データファイル(化学シフトと制限情報からなる実験情報)のアーカイブを公開しました。このNMR統合ファイルはNMR-STARまたはNEFで記述されています。このアーカイブを作成するにあたり、ポリマー配列、原子名、制限情報をPDBに登録された座標と照らし合わせ、可能な場合は修正しました。制限情報の統計及び診断情報については、対応するJSONファイルで確認してください。現時点で、このアーカイブは2463件の妥当なNEFファイルを含みます。妥当性はOneDepへの登録が可能かどうかの基準で判断しています。

Aug 31, 2020

新登録サーバBMRBDepによる登録受付を開始しました。従来のADIT-NMRによる新規セッションの開始受付は終了しました。ADIT-NMRは2020年12月末でサービスを終了するため、すでに登録作業を開始されている方は早めに登録を行ってください。

Aug 26, 2020

NMR統合データを用いて登録されたPDBエントリ（7JIA、7JIY）が初めてリリースされました。

Nov 27, 2020

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v2.0.16をリリースしました。

Jul 22, 2020

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2型(SARS-CoV-2)が引き起こす新型コロナウイルス感染症(COVID-19)に関するコンテンツを追加しました。

Nov 30, 2020

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v4.1.4をリリースしました。

May 4, 2020

OneDepは、NMR-STARまたはNEF形式の単一ファイルを用いたNMRデータの登録の受付を開始しました。

Feb 10, 2020

EMマップ/モデルの検証レポートに対応した代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v2.0.3をリリースしました。

Feb 1, 2020

BMRBに関する論文がMethod Mol. Biol.に掲載されました。

Jan 15, 2020

2020年3月から、OneDepシステムは、NMR-STARまたはNEF形式の単一ファイルでNMRデータのアップロードの受付けを開始します。wwPDB NEWS

Dec 25, 2019

EMマップ/モデルの検証レポートに対応した代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v2.0.1をリリースしました。

Dec 19, 2019

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v4.0.5をリリースしました。

Nov 19, 2019

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v1.6.5をリリースしました。

Feb 28, 2019

多次元NMRスペクトルの相互変換ツールxyza2pipe v1.0.4をリリースしました。

Feb 21, 2019

2019年7月1日より、結晶構造解析法によるPDBへの登録において、PDBx/mmCIFフォーマットファイルの登録が必須になります。以後、従来のPDBフォーマットは、結晶構造解析法で決定された構造のPDBへの登録に使用できなくなります。

Jan 25, 2019

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.18が公開されました。

Jan 18, 2019

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.15が公開されました。

Jan 15, 2019

mmCIF-validation, mmCIF-validation-altの各アーカイブがHTTPまたはrsyncプロトコルで公開しています。これらのアーカイブは実験的であり、将来の各アーカイブの維持、公開を保証するものではありません。

Dec 22, 2018

NMR-STARに関する論文がJ. Biomol. NMR.に掲載されました。

Dec 19, 2018

代替wwPDB構造検証情報作成ツールpdbx-validation v1.4.0をリリースしました。

Dec 6, 2018

XMLスキーマに基づいたデータベース複製ツールxsd2pgschema v3.0.8をリリースしました。

Nov 19, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.12が公開されました。

Oct 24, 2018

PDBアーカイブに関する論文がNucleic Acids Res.に掲載されました。

Oct 5, 2018

トーゴーの日シンポジウム2018において、PDBj-BMRBの活動と代替wwPDB構造検証レポートに関する発表を行いました。

Sep 16, 2018

第５６回日本生物物理学会年会において、代替wwPDB構造検証レポートに関するPDBjランチョンセミナーを開催しました。

Aug 31, 2018

BMRB/XML、BMRB/RDF、BMRB/JSON、BMRB RDB Snapshotの各アーカイブは、NMR-STAR Dictionary v3.2.1.9に対応しています。

Aug 17, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.9が公開されました。

Jul 5, 2018

SSLを有効にしたウェブサービスを始めました。

Jun 29, 2018

BMRBメタボロミクスエントリーのためのnmrML変換ツールBMSxNmrML v1.2.0をリリースしました。

Jun 9, 2018

OWLリテラルの全文検索インデックス作成ツールowl-indexer v1.2.5をリリースしました。

Apr 17, 2018

BMRB/XML、BMRB/RDF、BMRB/JSON、BMRB RDB Snapshotの各アーカイブは、NMR-STAR Dictionary v3.2.1.5に対応しています。

Apr 13, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.5が公開されました。

Apr 9, 2018

PDBML-validation, wwPDB/RDF-validationの各アーカイブがHTTPまたはrsyncプロトコルで公開しています。これらのアーカイブは実験的であり、将来の各アーカイブの維持、公開を保証するものではありません。

Apr 5, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.1.2が公開されました。

Mar 29, 2018

MagRO-NMRViewとノイズフィルタリング機能を搭載したNMR自動解析支援ツールのFilt_Robot用動作イメージファイル（VirtualBox用）の更新版を公開しました。

NMRToolBOXの各ページからovaイメージをダウンロードできます。

Feb 5, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.0.15が公開されました。

Feb 9, 2018

BMRB/XML、BMRB/RDF、BMRB/JSON、BMRB RDB Snapshotの各アーカイブは、NMR-STAR Dictionary v3.2.0.15に対応しています。

Feb 7, 2018

PDBj-BMRBで開発されたBMRBxTool、BMRBoTool、BMSxNmrMLのソフトウェア構成管理サイトを移行しました。ソフトウェア使用ライセンスはApache Licence V2です。

Jan 24, 2018

NMR-STAR Dictionary v3.2.0.13が公開されました。

Jan 24, 2018

BMRB/JSONアーカイブを更新しました。

Dec 20, 2017

BMRBメタボロミクスエントリーのためのnmrML変換ツールBMSxNmrML v1.1.0をリリースしました。またnmrML文書をv1.0.rc1からv1.0.0に更新しました。

Dec 4, 2017

OWLリテラルの全文検索インデックス作成ツールowl-indexer v1.2.2をリリースしました。

Nov 22, 2017

ノイズフィルタリング機能のクイック導入マニュアル（英語）をリリースしました。

Nov 22, 2017

MagRO-NMRViewとノイズフィルタリング機能を搭載したNMR自動解析支援ツールのFilt_Robot用動作イメージファイル（VirtualBox用）のリンクを修正しました。

NMRToolBOXの各ページからovaイメージをダウンロードできます。

Nov 8, 2017

BMRB RDB Snapshotは、PostgreSQL 10のツールチェインに基づいています。

Oct 19, 2017

ディープニューラルネットワークを応用し、ピーク同定とノイズフィルタリング機能を搭載したNMR自動解析支援ツールFilt Robotをリリースしました。

Oct 16, 2017

nmrMLに関する論文がAnalytical Chemistryに掲載されました。

Oct 12, 2017

多次元NMRスペクトルの相互変換ツールxyza2pipe v1.0.3をリリースしました。

Oct 11, 2017

NMR解析支援ツールMagRO-NMRView 2.00.12をリリースしました。 新たに深層学習によるノイズ・信号認識フィルタ機能が追加されました。

Oct 10, 2017

BMRB/XML、BMRB/RDF、BMRB/JSON、BMRB RDB Snapshotの各アーカイブは、NMR-STAR Dictionary v3.2.0.11に対応しています。

Sep 26, 2017

NMR-STAR Dictionary v3.2.0.11が公開されました。

Sep 18, 2017

PDBj-BMRBのData-out活動に関する論文がProtein Scienceに掲載されました。

Apr 25, 2017

NMRBox, A Resource for Biomolecular NMR Computationに関する論文がBiophysical Journalに掲載されました。

Mar 7, 2017

OneDepに関する論文がStructureに掲載されました。

Oct 1, 2016

従来のADIT-NMR登録システムは、停止しました。wwPDB news
新しいADIT-NMR登録システムは、引き続きデータ登録を受け付けています。wwPDB OneDepで登録された構造に関連するNMRデータ（例えば、緩和実験データや時間領域データ）、３次元構造の登録を伴わないNMR実験データ（BMRB Only）が登録可能です。

Sep 21, 2016

2016/10/1（土）、東京お台場にて開催される第5回生命医薬情報学連合大会にて、PDBjランチョンセミナーを実施します。

May 31, 2016

従来のADIT-NMR登録システムを使った、新しい登録の受付を終了しました。従来のシステムで登録を開始し、中断されている方は、2016年9月30日までに登録を完了させてください。新規登録にはwwPDB登録システムをお使いください。wwPDB news

May 5, 2016

BMRB/XMLとBMRB/RDFに関する論文がJournal of Biomedical Semanticsに掲載されました。

Mar 7, 2016

新たにNMR、EM構造について、validation reportがご利用頂けます。wwPDB news

Feb 1, 2016

wwPDBの登録システムからNMR、EMで解析された構造をご登録頂けます。